经过一番艰苦鏖战，救世主战部渡（瓦塔诺）终于和伙伴们打败了多古达及其暗黑军团，创界山（左开山）再次回复原本的秀美景色。在此之后，渡回到人类世界，和朋友们过着快乐的生活。然而好景不长，多古达的弟弟多坏达入侵与创界山息息相关的南斗七星星界山，七色彩虹失去色彩，黑暗重新笼罩大地。在这危急时刻，创界山的人民重新找回渡，请求他打败多坏达军团。渡从圣龙殿女王那里得到许多有用的道具，随后和龙神丸、忍部火美子（希米格）飞往星界山，与先行前往的剑部施巴拉古大师和古拿玛会合。激烈的正邪大战再一次拉开序幕……本片为《魔神英雄传》系列第二部。

大楚皇后姚莫心在朝中被奸人所害，而一场雷雨闪电之后，她的魂魄却到了妹妹姚莫婉体内，而姚莫婉此刻正在被敌人追杀，在危机时刻掉下悬崖失去了记忆。姚莫婉与大楚肃亲王夜君清在一系列的阴差阳错之下逐渐相爱，可就在两人都想互表心意的当头，姚莫婉知道了自己就是姚莫心的事实，也知道了自己曾经被仇人所暗害。为了报仇，姚莫心凭借妹妹姚莫婉的身体，再次进入皇宫。初入皇宫之时，姚莫婉在几个妃子之间找到了杀害姐姐莫心的仇人，并认识到了皇帝夜鸿弈的本质，狠下心来要替夜君清夺回江山。为了复仇，姚莫婉先后结识楚漠北、寒锦衣等痴情而又无所求的各色人物，欠下数不清的情债。姚莫婉终于实现自己的承诺，报了血海深仇，也还心爱之人夜君清锦绣河山。

住在意大利那不勒斯的青年乔鲁诺·乔巴拿，是继承了乔斯达家宿敌·DIO之血脉的儿子。幼年时遭受迫害而自暴自弃的他，由于拯救了一名黑帮男子，而学到了“相信他人”。不忘恩义、带着敬意对待自己的黑帮，让他的心变得率直。就这样，乔鲁诺开始对“黑帮明星”怀有憧憬。15岁的乔鲁诺，与统领意大利黑社会的黑帮组织“热情”一同引发事端，并成为被盯上的目标……

一名作家在作品未完成之时不幸撒手人寰，留下了作品中没有结局的王子（矢剃直树 配音）独自徘徊，王子和故事中的宿敌乌鸦来到了现实世界中，为了保护现实世界里的生灵，王子用自己的心封印了邪恶的乌鸦。                                                                      　　作家的鬼魂不甘心看到自己的故事就此停滞，他给了一只鸭子一条神奇的项链，鸭子因此而化身成为了雅喜儿（加藤奈奈绘 配音），她的使命就是找到王子因为封印乌鸦而四处散落的心之碎片。一次偶然中，法齐亚（樱井孝宏 配音）拾得了王子的心脏，将其取名为缪，害怕雅喜儿将缪诗夺走的法齐亚禁止两人见面，但缪诗反而因此而对雅喜儿充满了好奇。

在人类的历史和传说中记载着许多妖魔鬼怪的故事，很少有人知道他们是真正存在的，而它们的本来面目竟然是一种植物生命体。日本传说中的荒神也是这种植物生命体。而传说中被从高天原流放的天照大神之弟须佐之男竟然是它们的首领。而传说中他从八歧大蛇口中所救的女孩奇稻田姬则是代代转生，专为封锁荒神而存在的巫女，一旦巫女不能够自然死亡，那么日本所有的荒神就都将在第一时间死亡，但巫女活着又会制约它们的力量。所以历代的奇稻田姬都会在当时政府的严密监护下生活，而荒神们几百年一成不变的矛盾就是又想杀死又不得不保护。                                                                      　　到了藤宫红叶这一代，问题发生了变化，继承奇稻田姬力量的是一对孪生姐妹红叶和枫，由于封印力量的减弱，荒神们又逐渐恢复了力量，而须佐之男竟然也开始慢慢复苏。荒神们制造了一个结界，准备在里面杀死红叶，以确保自身不受影响。但一个神秘的少年草雉，却打算在荒神动手之前抢先杀死红叶。原来草雉是荒神们培养的秘密武器，八歧大蛇把自己的荒神力注入人类孩子的体内，那就是草雉。他为了摆脱控制，决定抢先杀死红叶，以便令所有的荒神死亡。然而，渐渐地他却对红叶产生了另外的感情……

海鸥学园的奇妙传言之一。据说旧校舍三层女厕所的第三间里的同学，会实现前来拜访者的愿望。非常喜欢巫术等超自然现象的少女八寻宁宁为了实现自己的愿望，将之托付给了学园怪谈……

奥林匹克众神中不乏妄图统治天空、海洋、大地的野心之辈，在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。

『被霸凌的孩子』南云始与同班同学一起被召唤至异世界。虽然同学们接连显现战斗取向的特殊能力，但始却只拥有炼成师这种平凡的能力。而且在异世界仍为最弱的他，竟被某位同学恶意推落了迷宫深渊──！？