故事发生在风景如画宁静祥和的镰仓，橘一夏（本多阳子 配音）是出生和生活在这里的平凡中学二年级女孩。性格温文尔雅跟所有人都能成为朋友的篁萤子（落合祐里香 配音）、性格活泼开朗元气满满运动神经十分发达的多岐川皋月（川上伦子 配音）和身世非常神秘常常展现出超越了年龄的成熟与知性的宗方未知留（田村由香里 配音），这三名性格迥异的女孩是橘一夏的好友，四人之间感情十分要好。                                                                      　　在学期的最后一天，一夏离开学校之后发现自己十分珍爱的护身符丢在了教室，于是返回了学校，在那里，一夏邂逅了名为黑城舞夏（浅野真澄 配音）的少女。命运的齿轮开始了转动。

乍看之下，宫本蕾贝卡（斋藤千和 配音）是一个满头金发的11岁少女，她的外表可爱个性胆小，是个人见人爱的小不点。令人想不到的是，蕾贝卡居然是毕业于麻省理工大学的天才少女，并且，她还有着一份正式的职业——桃月学院一年C班的班主任。面对着这个娇小的班主任，一年C班的同学们发出了不可置信的呼声。然而随着接触的深入，他们发现，这个外表萝莉的老师，却有着一颗正直勇敢的心。                                                                      　　在桃月学院里出没着各式各样有趣的家伙， C班的神秘老头子（大竹宏 配音），D班的酒鬼五十岚美幸（大原沙耶香 配音），B班的早乙女（花轮英司 配音），再加上每个班级里鬼灵精怪的同学们，蕾贝卡快乐的校园生活开始了。

观束总二（岛崎信长 配音）是一位各方面看来都十分平凡的高中男生，要说唯一的不同，那就是他对于双马尾发型有着超乎常人的热爱和执念。某日，一位名叫朵艾儿（内田真礼 配音）的神秘女子突然出现在总二的面前，来自异世界的她的出现彻底改变了总二的一生。城镇之中忽然出现了大量来自异世界的怪物，彻底搅乱了人们平静的而生活，朵艾儿赋予了总二变身的力量，总二变身成为了红马尾战士（上坂堇 配音），展开了和异形的殊死搏斗。随着时间的推移，津边爱香（相坂优歌 配音）变身的蓝尾战士，神堂慧理那（赤崎千夏 配音）变身的黄尾战士，依丝娜（日笠阳子 配音）变身的黑尾战士纷纷加入战局。

布兰登和哈利是平民窟里混大的哥们儿，勾肩搭背成了无数小混混中的典型——心比天高，以为凭着年轻和不怕死可以把整个世界都踩在脚下。然而真正的上位者略动动小指，他们的世界已是天崩地裂。两人失去了一切有被逼入死地，当有了绝境逢生的机会，哈利迫不及待的加入了黑手党，他再也不要过落水狗一般的生活。布兰登只是犹豫了一下便跟定了他——他们已经习惯了是福是祸一起分担。布兰登深收黑帮老大Big Daddy的喜爱。成了组织的最强杀手。而哈利为了自由支配和给予权利，用尽手段不断往上爬，成为了组织的“背叛者”，成为了布兰登的清除对象……而布兰登下不了手，他的心还是当年那个黑发少年。可哈利不是了，他要先下手为强，他不能容忍任何阻挡自己往上爬的道路……

在同学的眼中，森田真由（花泽香菜 配音）是一个沉默寡言的神秘女生。其实，真由的个性并非如此，母亲森田由美（七瀬亜深 配音）的教导影响了她的性格，导致真由每一次想要说话的时候，都在脑中进行着信息量巨大的深思熟虑，而正是这样的思考，另真由错过了最佳的应答时机，久而久之，落下了无口女的称号。                                                                      　　但是，这样的真由并不寂寞，率真坦诚的村越美树（戸松遥 配音），知识量充沛的三浦千寻（早见沙织 配音），单纯野性的松坂花（南条爱乃 配音），学习和运动皆是万能的山本（平贺三恵 配音），在这些同学的陪伴下，真由的学校生活常常充斥着数不尽的惊喜和笑料。

外表像女孩子一样可爱的二鸟修一（畠山航辅 配音）常常遭到同龄男生的欺负和嘲笑，和女生却相处的分外融洽，长此以往，修一生出了“想成为女孩子”的念头。与此同时，女生高槻佳乃（瀬戸麻沙美 配音）因其帅气的外表被赋予了“老弟”的外号，但其实佳乃有着意外柔软和脆弱的内心，“如果真的能够成为男孩子就好了”，佳乃是这样想的。一次偶然中，就是这样的两个人，他们相遇了。                                                                      　　在偏远的小镇，远走高飞的两人过起了交换身份的生活。在最初梦想达成的快乐过去后，越来越多的问题和麻烦渐渐浮出水面，被身份和性别困扰着的两人，能否在互相的支持和照应之下找到自己真正想过的生活呢？

1999 年，为了使人进化为“完美的个体”，由NEO（Next Environment Organization）领导并开始实行BESTMAN计划，但是结果是失败了。试验将尊者ヤクスギ进化成了拥有无限再生能力的カンケル（Cancer）。不仅如此，作为整个人类社会的敌人，カンケル的目的就是消灭整个人类，但是首先他就必须要消灭一直保护着人类的共生免疫体——ベターマン（Betterman）。而当时在场的其他几位幸存着则把カンケル存在的消息以一种蛋白质的形式传播出去，并引起人类自毁灭的DNA程式，它所造成的离奇疾病就是アルジャーノン，而这种疾病的目的就是召唤出人类的免役体ベターマン。

自古能够呼唤传说中的鬼神“饿沙罗鬼”的豪和一族，在现代已是拥有跨国企业的强大财团。而豪和家的四子优四郎是惟一能用“饿沙罗之舞”呼唤鬼神的继承者，他同时也是战斗甲胄“雷电”的驾驶员。在优四郎进行“饿沙罗之舞”仪式之时，脑海中突然出现一名执刀的绿发少女，似曾相识的她是敌方的驾驶员美晴，而两人波澜起伏的命运从此拉开了帷幕……