肖逸（冯建宇 饰）、吴信（王蕴凡 饰）、尹正风（陶思源 饰）三人同时被人谋杀致死,DOA系统的管理员出现，告知三人只要协助管理员恢复DOA系统的正常，即可回到以前。于是，肖逸三人想方设法恢复DOA系统的正常， 然而，肖逸等人的行动及其身上存在的疑点引起了私家侦探林灭的注意，林灭派他的徒弟荆灵（彭渤 饰）接近三人，想要探寻他们的真实身份。肖逸和荆灵是初中时期的同学，对女大十八变的荆灵心生情愫。 之后，三人的行为触动了DOA系统的潘主管，潘主管则是铁了心要将记录在错误录入在DOA系统名单上的人收割，完成自己的使命，而他第一个要收割的，就是荆灵。
《神犬小七》总制片人、总发行人何静在8月的一次媒体采访中，透露称“第三季和第四季的剧本已经写好了。《神犬小七第三季》即将于2016年12月16日在广东、福建和海南开机，神犬系列IP会一如既往地延续下去，将更具正能量的精彩剧集呈现给粉丝观众。”何静还透露称《神犬小七第三季》中拉布拉多犬小七将晋升为一名职业搜救犬，但是无论是吴玉江还是何静，二人均未透露过除了拉布拉多犬小七之外的其他任何演员名单。
