第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。

内地出生的梁欢上世纪八十年代与女儿李友好来到香港和丈夫李高山团聚，岂料李高山却意外身亡。失去依靠的梁欢，唯有独力守住亡夫的茶餐厅。不屈不挠的她，幸得李高山生前好友罗一同和劳金帮忙，在茶餐厅员工的支持下，一起在逆境中奋斗向上，同舟共济。1997年香港回归祖国，梁欢、罗一同与劳金的子女李友好、罗梓良、罗梓康、劳永逸、劳永安及谢朗峰也长大投身社会。他们经历了亚洲金融危机、非典疫情、美国次贷危机，面对事业、未来与情感的抉择，依然携手努力打拼，发挥狮子山精神，不仅在香港的事业得到发展，还把茶餐厅业务拓展到内地。他们相信，只要香港与祖国同心，在祖国的强大支援下，香港一定会迎来更美好的将来。

法政先锋们的故事还在继续，这次的主角是法证部的高级化验师布国栋（黎耀祥 饰）。号称“人肉百科全书”的国栋知识渊博，且一直不断学习，他与法医科高级医生钟学心（张可颐 饰）既是事业上的伙伴，又是生活中的好友，共同研究工作上的疑难杂事，又互相倾诉生活中的困扰。学心的好友凌倩儿（徐子珊 饰）任职于西龙九重案组，作为高级督察的她，身手了得，和警长李展风（吴卓羲 饰）是好拍档。法医部、警界等因为各类案件而经常需要合作，而正是在他们的联努力下，一起起棘手的案件被侦破。
布国栋和妻子周奕霏（胡定欣 饰）因为观念不和，最终以离婚收场，而他与学心的感情也与日俱增，学心童年悲惨的经历让他们把目光投向了新的案件上

本剧集讲述香港海关特遣队队员在事业上和生活中的点滴故事。在事业上独立果敢的海关特遣队监督吕馥明（汪明荃饰）已投身海关二十多载，年过五十岁的她仍对爱执着，相信至死不渝的爱情存在。出版集团主席涂令山（李修贤饰）感情专一内敛，向不信情。海关督察林志刚（王喜饰）自小受父亲严厉鞭策，性格急进。立志投身海关的特遣队新成员冯满芬（宣萱饰），做事勇往直前，对人生充满理想。在事业上，这些特遣队精英们屡立奇功，而在情感道路上，他们的生活也遭遇了爱的惊涛骇浪。32集香港警务纪实电视剧《雷霆第一关》，由香港TVB知名艺人宣萱、王喜、汪明荃等联袂出演。

单元《一》：《老夫少妻》张帆，年廿八，嫁予港人贺丰年为妻，从一个大陆农村女子，变为一个街市鱼档的事头婆。年较帆年长二十多岁，虽是老夫少妻，缺少浪漫，但年对帆疼惜有加，二人生活虽是平淡总算惬意。年在友侪面前娶得少妻，引来不少羡慕目光；而;帆嫁予年后不单克守本份，更是年生意上的助手。但日久生变却是不变定律，更何况二人年龄上的差距，夫妻生活不协调，帆对年遂生厌弃，虽不宣之于口，但内心的不满情绪就如压力煲似的在酝酿。一次偶然，帆无意邂逅了石油气店的小伙计欧阳明，明的不羁与活力，正是年所没有，是她内心一直所渴求的。二人一次放纵作出了苟且之事。帆贪恋明的年轻活力，明也贪恋帆的金钱，二人食髓知味难舍难离，瞒着年在旧居共赋同居，但二人之事却为街市娴无意所撞破。娴本钟情于年，但因早年失婚并育有一双儿女，自惭形愧；及后年往大陆娶妻回，娴更是心如止水，但仍视年是知己。年得知帆红杏出墙，惴惴不安，暗中跟踪帆来到旧居，帆见年突然出现，表现失措，诸多借口欲阻年上旧居，年更觉可疑，二人争持，打开旧居大门之际，竟发现失踪多天的明竟与“忽得妹”BiBi在胡混，BiBi向帆挑衅，帆向明大兴问罪，年大顶绿帽迎头至，怒不可遏，向明饱以老拳，一轮混战，明、帆错手将年击毙，三人对尸呆然。帆决定与明双宿双栖，亡命天涯；但当得悉明的心只是为了夺取自己毕生积蓄后，登时晴天霹雳，变得歇斯底埋…一切罪孽皆因一「贪」字…帆蓦然回首百回想往事，已是万劫不复…

故事围绕著一间护老院展开，新来的行政经理凭著他以往的行骗经验，意外地与院友打成一片。

少年云飞扬（徐少强 饰）的身世扑朔迷离，尽管与武当派掌门青松（张瑛 饰）有着特殊的关系，但他在武当派的地位却非常低微。后来，云飞扬得到了一位神秘黑衣人的秘密武功传承。青松与武林名将独孤无敌（杨泽霖 饰）多次交手，但都战败于对方手下，导致独孤无敌成为武林的霸主。与此同时，武当山上发生了一连串离奇的血案，都与云飞扬有关。最终，青松惨死，飞扬心情复杂，离开了武当山。当时，武林中流传着一种神奇的武功——天蚕诀，如果练者掌握不精，就会束缚自己，甚至丧失自身的武功。但如果能领悟其中的奥秘，并掌握变化之道，就可以将武功提升到化境，成为武林中地位最高的盟主。

香港飞行服务队(GFS)二级空勤主任高可风(郑伊健饰)和一级机师叶青云(林保怡饰)一个负责拯救一个负责驾驶，合作默契。可风的女友康友岚（佘诗曼饰）三年前因车祸昏迷，至今未醒。可风每天都去医院探望，终于奇迹发生，友岚苏醒过来，但是失去所有记忆。在可风的热情下重新接受他。叶青云与妻子离婚多年，独自带着可爱的儿子Jacket生活，感觉不到房东兼同事小娟对他的爱意。GFS新一届的学员诞生，风、云分别担任施楚淇（钟嘉欣饰）与见习机师蒋加诺（黎诺懿饰）的导师，淇自小被父亲抛弃，在孤儿院长大，自卑感严重；而加诺是富家少爷，但家庭突遭巨变。面对种种压力，他们能否顺利毕业？而友岚感觉被热心助人的可风冷落，感情渐渐偏向叶青云，突然的恢复记忆让她忆起了当日车祸的真相。他们的感情线将何去何从？

保险经纪阿威（秦沛 饰）早年妻子离世，与独生女儿阿怡（杨千嬅 饰）相依为命。阿威的妹妹阿美（苑琼丹 饰）屡次婚姻失败，因此威对女儿即将从国外带回来的男友分外留心。当他发现女儿的男友是好色之徒的时候，阿怡却不相信，父女大吵一架。此时阿威工作上的拍档陈有充（张家辉 饰）迫于无奈介入了这对父女之间的矛盾中，阿充怎么也没想到会与阿怡日久生情，加上阿充因为工作表现突出，被调到了阿威工作上死对头的那组，阿威生气之极，极力想拆散阿怡与阿充的感情，笑料百出。两情相悦的阿怡与阿充还是排除了万难，结为夫妻。不习惯女儿已经出嫁的阿威，过分关注夫妻两的生活，使他们倍感困扰。后来二人的感情更受到了更重大的挑战……

丁善本（罗嘉良 饰）在6岁时因父母沉船身亡，弟弟不知所踪。后来他被丁荣帮（秦沛 饰）收养，荣邦视善本为己出，把金业生意全盘交给善本打理，本却因养父与犯罪集团勾结而被捕，没想到的是拘捕善本的是他的亲生弟弟钟守康（温兆伦 饰）。                                                                      　　善本在澳洲公干时邂逅了程天蓝（宣萱 饰），此时二人的关系陷入僵局，虽然最后水落石出，但善本的家庭背景阻碍了两人的发展。善本因养父的关系多次与守康发生争执，为了避免影响守康的前途，善本决定不与守康相认。而善本也知道守康一直喜欢天蓝，便决定忍痛与天蓝分手。                                                                      　　义弟丁善行（林峰 饰）受叔叔的挑拨继而认为善本杀害了父亲，无奈之下善本只好把刚走回正道的生意归还给善行。善本渐渐得到守康与天蓝的谅解，却再次卷入了江湖斗争中……