廉政公署收到报案人廖雨萍（周秀娜饰）的实名举报，举报正在坐牢的富二代曹元元（林峯饰）涉嫌行贿监狱里的监督沈济全（谭耀文饰）以及惩教员，首席调查主任陆志廉（古天乐饰）决定深入虎穴，卧底狱中。在监狱里，被陆志廉送入监狱的前警司黄文彬（林家栋饰）以及曹元元两大帮派势成水火，陆志廉趁机接近曹元元取得信任。同时监狱外的廉政公署总调查主任程德明（郑嘉颖饰）、国内反贪局行动处处长洪亮（丁海峰饰）也陆港联手，通力合作，最终成功破获贪腐行贿大案。
杜奕天领命卧底，靠着自身过硬的本领逐渐得到了集团二号人物林国荣的信任。却不想三号人物洪康为了上位，挤掉林国荣，设计陷害林国荣和杜奕天，使其遭追杀。逃亡过程中杜奕天竟无意中在林国荣的手机里发现了惊天机密，而自己的卧底身份，也被洪康发现了......
郭豪盗取了四海集团的巨钻九龙壁，原想了结个人恩怨后决定金盆洗手。国际刑警也追查了四海集团很久，由于梁生大律师的身份，一直为黑蛇的不法行径洗白，所以始终没有得到有效证据。郭豪盗取了九龙壁，回程路上遇上黑蛇手下，郭豪偶遇林悦，两人假扮情侣躲过追踪。梁生发觉警方介入调查，主张暂避锋芒，放弃了钻石。黑蛇对梁生的做法感到不解，与梁生产生了分歧。黑蛇的杀手集团与郭豪展开激烈角逐，郭豪意识到行动的危险，让助手安宁暂时躲避。未料，铁虎出手杀死安宁。郭豪悲愤不已，而此时黑蛇抓了林悦，约郭豪见面。郭豪与警方取得联系，对黑蛇实施抓捕，黑蛇最终落网。郭豪为救林悦，倒在血泊中。林悦伤心欲绝，失声痛哭。
经过多年的追查，香港廉政公署准备对理达贸易集团负责人陈超群以及海关官员钟嘉玲（袁咏仪 饰）就非法内销行贿行为进行起诉。可是在开庭前夕，作为举报人和证人的理达的前任财务总监许植尧（张家辉 饰）临时改变出庭打算，启程前往澳洲。法庭给出七天限期，为此，该案负责人陈敬慈（刘青云 饰）和同在廉政公署供职的妻子江雪儿（林嘉欣 饰）联合展开调查。陈倾尽全力追查陈超群走私行贿的实证，并试图揪出其背后的大老虎。江雪儿则远赴澳洲，力劝许植尧回港作证。
童年兄弟意外失散，30年后因一桩罪案相见，两人已身处不同阵营。随着对罪案调查的深入，一个多年来隐于幕后的恐怖组织渐渐浮出水面。
毒品市场维持四分天下的格局已久，但自从地藏与墨西哥大毒枭跨境合作扩展势力，再加上一连串黑吃黑的动作，毒界变得风声鹤唳。另一方面，因儿时亲眼目睹父亲被毒品所毁而嫉毒如仇的慈善家兼金融巨子余顺天，正悬赏一亿歼灭香港最大毒贩，此举在社会上引起轩然大波。警员林正风本致力搜证拘捕地藏，毒贩却因巨额悬赏导致人身安全受威胁，他在执行保护毒贩的任务时深感无奈，但又被余顺天的出价所诱惑，陷入黑白正邪的心理挣扎。原来，余顺天和地藏有不可告人的同门关系，一场天地对决一触即发。
