阿香（叶玉卿 饰）从美国动完眼疾手术归来，暂时失去视力三天。丈夫Jack（陈友 饰）是心脏科医生，要去澳门开一个重要研讨会，遂留妻子与仆人阿梅独自在家。 阿梅出去买哮喘药时，神秘男子朱森（黄秋生 饰）在后院内借机与阿香搭讪，说自己是Jack的小学同学，天真的阿香于是请他入屋坐。 朱森坐了一会就告辞。天开始下雨，阿香小睡片刻就有人敲门，她以为是阿梅，却不料朱森又折了回来，说是叫不到出租车。 阿香于是让他换上自己丈夫的干净衣服，朱森告诉阿香自己是印刷工，与老婆感情本来很好，却不知为什么从某个日子开始老婆开始不让他碰。气急败坏的他越说越激动，阿香感到害怕，请他离开。惭愧的朱森再次告辞。 盲阿香摸索着到浴室洗澡，却不料朱森正在哪里等着她…
在都市内出现了连续女性被杀事件。经警察调察，犯案者是异形怪物，而主角·风祭真因为一直发着相关事件的梦而备受困扰…… 风祭真的父亲是遗传学研究所里的科学家。而真则自愿成为了研制不治之病的实验品，但却被疯狂的科学家·鬼塚实行的现阶段最危险的生化实验·Lv3的遗传因子操作实验而变成了生化战士：真·假面骑士。但鬼塚最大的目的就是要将真供幕后BOSS·“财团”作为军事武器。真最后逃出了『财团』的魔掌，并且与“财团”的超级改造战士·豪岛展开生死战！
宫园彩夏（秋元才加 饰）是东京一座内科医院的护士，在一场意外中，她脊髓受伤，半身不遂，这也就意味着，年仅23岁的彩夏，她的下半生要在轮椅上度过了。如此噩耗让彩夏的脸上失去了笑容，对待周围关心她的人亦非常的粗暴，其中包括彩夏的母亲洋子（大鸟丽 饰）。 几天之后，彩夏的男友后藤（森工隆 饰）前来医院探望，实际上，后藤是有妇之夫，彩夏和他一直保持着不伦的关系。这注定没有结局的恋情让彩夏倍感抑郁，她甚至想要结束自己的生命。在这个节骨眼上，彩夏遇见了名叫五十岚翔太（片冈直人 饰）的男孩，和彩夏一样，翔太也坐着轮椅。
香港庙街，各路势力云集，犬牙交错。身体残疾、在黑帮老大烟铲乐手下讨生活的盲辉（曾国祥 饰）与大陆偷渡过来的女孩小惠相恋。PTU部队利用盲辉端掉黑社会团体和联胜的贩毒窝点，引发和联胜老大丧昆与烟铲乐的冲突。丧昆追杀盲辉之时，遭到乐之手下火爆的伏击，坠楼而死。 鉴于恶性案件时有发生，警局展开大规模扑杀行动，庙街中由黑社会把持的店铺被迫关闭。烟铲乐恼羞成怒，迁怒盲辉，致使其与女友流落街头。李永森（任达华 饰）执勤途中逮捕了滋事的小惠，令盲辉对这个导致自己幸福破碎的沙展萌生恨意……
经过厚生省官员白鸟圭辅（仲村亨 饰）和东城大学附属医院心理治疗内科的医生田口公平（伊藤淳史 饰）的全力奔走，日本终于引进了首台新型核磁共振成像（MRI）仪器“利维坦”。与此同时，某栋高级别墅地下室内，九人离奇死亡，其中则是厚生省中唯一支持白鸟引进利维坦的船桥审议官。高傲张扬的海归教授东堂文昭（生瀬胜久 饰）李勇刚组装好的利维坦查明死因，却也让白鸟对其产生怀疑。另一方面，在Ai中心举行研讨会前不久，田口收到一封威胁摧毁三头犬之塔——利维坦的恐吓信。在美丽记者别宫叶子（桐谷美玲 饰）的协助下，田口察觉这一系列事件很可能是对白鸟怀恨在心的樱宫堇（栗山千明 饰）所为。 时间一分一秒流逝，利维坦和Ai中心迎来吉凶莫测的关键时刻…
