城市中出现了来历不明的光病毒。 SRC中的Eyes队成员为要确认光源搜寻至镝矢岛，遇上了对怪兽充满爱心的预备飞行员春野武藏。此时，光病毒入侵怪兽力特里亚斯体内，力失控，Eyes准备向力发动攻击，武藏决要阻止，危急中，超人高斯终于回来。
在银河的中心支配宇宙的贵族联合舰队与在贵族联合军中崭露头角的贝蒂率领的新贵族舰队发生激烈冲突。这场关系着宇宙命运的战斗以新贵族舰队的胜利告终。 之后，贝提建立了神圣帝国，成为初代皇帝。但是这场战争带来的并不是和平，而是新的专制制度的开始……于是，为打倒贝提政权而站起来的是密雪尔率领的人民军。 有一天，他们潜入了贵族的结婚仪式，成功夺取了领土战舰，但被玛可涅率领的神圣皇帝军舰队的追击击败。当密雪尔被投降的人献出去时，将宇宙的黑暗切断的光芒贯穿了玛可涅的巨型舰。这道光，代表了库雷奥所率领的玻璃舰队压倒性的强大。 舰长库雷奥放言，为了延续王家的血，让王家复辟，他要用这一艘战舰取得天下。在她身上，密雪尔看到了新时代救世主的影子。 另一方面，虽然十字星法王格尔纳为女儿蕾切尔向贝提求婚，却以时机尚早为理由遭到拒绝。但是，在那晚的假面舞会上，在互相不知道底细的情况下，贝提与某个女性相遇。被各种邂逅引导，他们的命运将是……
故事开始于一个宇宙中心的一个星球。“银河铁路”的全部的始发站迪斯特尼,主人公有紀学（ユウキマナブ）20岁，继承已故父亲和兄的意思入队守护银河铁路的安全的空间铁路警备队 (通称“SDF”)。SDF，在宇宙中维护银河铁路的运行日程的利益，因为各交通线路发生的事故，自然灾害和救命急救和宇宙海盗的讨伐等。 并与一个谜样的美女蕾拉相遇,她具有人和生物，惑星的命运的预见能力！蕾拉帮助着铁道站的旅行者们而被称为命运的守护者.然而,威胁银河铁道的最大危机迫近,而有纪的命运又会如何呢.
