城市中出现了来历不明的光病毒。 SRC中的Eyes队成员为要确认光源搜寻至镝矢岛,遇上了对怪兽充满爱心的预备飞行员春野武藏。此时,光病毒入侵怪兽力特里亚斯体内,力失控,Eyes准备向力发动攻击,武藏决要阻止,危急中,超人高斯终于回来。
铃木入间(村濑步 配音)被双亲卖给了魔王沙利文(黑田崇矢 配音),没想到沙利文因为没有子孙后代,所以对身为人类的铃木非常的溺爱。随着铃木渐渐长大,沙利文将他送进了恶魔学校巴比尔斯里深造,想要这所充满了恶魔的学校里生存下去,铃木的首要任务就是隐藏好自己的人类身份。
C.E.70年2月,地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月,在“非我即敌”的观念驱使下,地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候,少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后,背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后,他成为了ZAFT的战士......