恶德超市店长佐久间秀之（杉本哲太 饰）被人杀害，意外将四个多年不见的好友聚在了一起。秀之的弟弟直人（香川照之 饰）和现役警官飞奈淳一（江口洋介 饰）、美发店经营者岩本万季子（常盘贵子 饰）以及万季子的前夫清原圭介（堤真一 饰）是小学时代同一剑岛部的好友，当年他们曾一同经历了人生中重大的变故，这也成为四人共同保守且不愿回忆的秘密。淳一和精通犯罪心理学的南良凉（北村有起哉 饰）奉命调查相关嫌疑人。种种迹象表明，这起案件与27年前那起秘密事件有着不可分割的联系。随着调查的深入，记忆的闸门缓缓开启…… 本片根据横关大的原著改编。
经过厚生省官员白鸟圭辅（仲村亨 饰）和东城大学附属医院心理治疗内科的医生田口公平（伊藤淳史 饰）的全力奔走，日本终于引进了首台新型核磁共振成像（MRI）仪器“利维坦”。与此同时，某栋高级别墅地下室内，九人离奇死亡，其中则是厚生省中唯一支持白鸟引进利维坦的船桥审议官。高傲张扬的海归教授东堂文昭（生瀬胜久 饰）李勇刚组装好的利维坦查明死因，却也让白鸟对其产生怀疑。另一方面，在Ai中心举行研讨会前不久，田口收到一封威胁摧毁三头犬之塔——利维坦的恐吓信。在美丽记者别宫叶子（桐谷美玲 饰）的协助下，田口察觉这一系列事件很可能是对白鸟怀恨在心的樱宫堇（栗山千明 饰）所为。 时间一分一秒流逝，利维坦和Ai中心迎来吉凶莫测的关键时刻…
刑警闻峰在抓捕行动中开枪误伤平民，被迫停职接受督察部门调查。虽然调查最终证实了闻峰的清白，但此次意外在其心中留下隐患，致使他在另一次抓捕行动中英勇牺牲。闻峰的牺牲引起了连锁反应，英雄的归宿牵动人心……
两个来自于乡下的热血青年抱着对城市生活的憧憬和向往，在经过几年的奋斗之后，终于有了自己房子，乔迁之喜，吕秋和男友大川享受着温馨甜蜜的二人世界，而吕秋的爸爸，吕老爷子的不请自来彻底打破了这对恋人平静的生活。分别生长于农村与城市的老少两辈人，在太多问题上存在着隔阂。随着吕老爷子的出现，吕秋和大川的感情即将遭受前所未有的历练。
故事围绕两个13岁的男孩展开，他们的关系长久以来非常亲密，但同学之间对他们的关系产生猜忌，使他们不得不分道扬镳。而当一场悲剧发生时，其中一个男孩被迫面对他为什么与他最亲密的朋友疏远。
