这是发生在某个时代某个大陆的极为微不足道的小事。 有一个为了建设大规模娱乐设施而被要求全民撤离的村子。 但，当村民拒绝了这一要求时，整个村子连同村民在一瞬间就被破坏殆尽。 那里，是在小小的幸福当中度日的少年查普的村子…… 失去了一切，落入绝望谷底的查普，决定跨越悲伤展开复仇之旅。
200X年，会动的玩偶突然从宇宙来到日本。不知道为什么，他们攻击的目标都是日本各处有名的景点。防卫队为了保护日本而进行战斗，却受到为什么要向这么可爱的玩偶攻击的舆论责难，进退两难。这时候，有人提出要对抗如此可爱的东西，不用可爱的东西是不行的！就这样一个由三位小学生组成的特别防卫队成立了！
忍びの里から抜け出したくノ一さとこは、 街で行き倒れていたところを通りすがりの女子高生このはに救われる。 だがそれも束の間、さとこは里からの追手に見つかってしまう。 しかしそんな追手をあっさりと返り討ちにするこのは。 …なんと彼女の正体は殺し屋だったのだ！ 世間知らずのくノ一と殺し屋女子高生の危ない共同生活がスタート！
